PT. Pertamina Trans Kontinental ini merupakan perusahaan yang bergerak dalam menangani kegiatan keagenan port pertamina mengenai bongkar muat khususnya kapal-kapal yang beroperasi di naungan Pertamina dalam pengurusan in-out clearance kapal keagenan pertamina di pelabuhan pontianak. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui bagaimana sistem dan prosedur clearance in-out kapal keagenan pertamina mulai dari kapal datang hingga berangkat meninggalkan pelabuhan, dokumen yang diperlukan untuk in-out clearance serta instansi yang terkait dalam proses in-out clearance kapal dan hambatan atau kendala yang dapat menghambat penanganan in-out clearance kapal. Metode penelitian ini menggunakan metode kualitatif. Metode pengumpulan data menggunakan observasi, interview atau wawancara dan dokumentasi. Kesimpulan yang dapat diambil adalah secara keseluruhan agen di PT. Pertamina Trans Kontinental cabang pontianak sudah menjalankan tugasnya sebagai agen kapal dengan baik dalam melakukan clearance in-out kapal di pelabuhan Pontianak mulai dari kegiatan pengurusan permohonan kedatangan kapal di kantor (KSOP) hingga melakukan kembali permohonan keberangkatan kapal ke kantor (KSOP) untuk permohonan penerbitan surat persetujuan berlayar (SPB).